Czwarty i ostatni okres działalności mennicy gdańskiej przypadał na lata 1807-1814, kiedy to po rozbiciu Prus przez Napoleona, Gdańsk został ogłoszony Wolnym Miastem. Nowo utworzona mennica emitowała miedziane szelągi i grosze, które obiegały rynek do momentu usunięcia ich z obiegu dekretem z 1821 r., ustępując miejsca monecie pruskiej. Należy również nadmienić, że w tzw. okresie okupacji pruskiej, przypadającym na lata 1793–1807, rynek obiegała moneta gdańska w postaci szelągów. Monety te nie były jednak bite w mennicy miejskiej, a ich wykonanie zlecono mennicy berlińskiej.